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Resultados opuestos entre K de Blomberg y la señal filogenética en Phylocom (AOT)

Resultados opuestos entre K de Blomberg y la señal filogenética en Phylocom (AOT)


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He estado tratando de probar el conservadurismo filogenético significativo en algunos rasgos de las plantas. Hasta ahora usé R-package picante (Blomberg's K) y AOT en Phylocom. Hasta ahora, estos dos métodos producen resultados completamente opuestos para los mismos rasgos, y estoy confundido. ¿Es posible obtener resultados tan contrastantes de estos dos métodos?

Por ejemplo, un rasgo muestra K de Blomberg = 0.2892 (P = 0.001), lo que sugiere que la evolución de este rasgo en general no se ha visto muy limitada por la relación filogenética. En contraste, para el mismo rasgo, AOT produce varianza de contrastes estandarizados a través del árbol = 0.006, significación de la varianza de contraste en relación con el modelo nulo (rango bajo) = 1, y significación de la varianza de contraste en relación con el modelo nulo (rango alto) = 1000 (es decir , P = 0,002), lo que sugiere que el conservadurismo filogenético en forma de árbol es significativamente mayor que las expectativas del intercambio aleatorio de puntas.

Acabo de comenzar a observar estas señales filogenéticas, por lo que es posible que esté pasando por alto algo crítico. Le agradecería mucho si tuviera la amabilidad de darme direcciones, ¡muchas gracias!


Creo que me lo imaginé. Alguien me dijo que los resultados anteriores son los mismos. El valor absoluto de K = 0,29 indica que la magnitud de la señal es menor de lo esperado en un proceso de movimiento browniano, pero sigue siendo más que una expectativa aleatoria (según el valor P, P = 0,001). Por lo tanto, ambos métodos sugieren que el conservadurismo filogenético de los árboles es significativamente mayor que las expectativas aleatorias.

En realidad, los significados de la estadística K y el valor P se establecieron claramente en el artículo original (Blomberg et al. 2003). Debería haberlo mirado primero ... pero de todos modos, creo que ahora está resuelto.


Ver el vídeo: ESTAMOS PARA JUGAR EL MUNDIAL MAÑANA: El Pollo Vignolo y su análisis del triunfo ante Uruguay (Junio 2022).


Comentarios:

  1. Paget

    Inventaste rápidamente una frase tan incomparable?

  2. Hadley

    Estas equivocado. Estoy seguro. Puedo probarlo. Escribe en PM, discutiremos.

  3. Tauzshura

    He pensado y he quitado el mensaje.

  4. Jennelle

    La frase incomparable, es agradable para mí :)

  5. Mackay

    Por favor, no ponga esto en exhibición

  6. Moramar

    Por favor, cuente con más detalle.

  7. Ruben

    Pocos sentimientos.. pero hermosos...



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